Il fondatore del REIKI come sistema di guarigione naturale è il Dottor Mikao Usui.

Alla fine del secolo diciannovesimo, nel tardo '800, il Dottor Usui era il rettore di una piccola Università Cristiana a Kyoto, in Giappone: la Doshisha University. Egli era anche un sacerdote cristiano.

Un colloquio con uno studente, all'inizio di una funzione domenicale, cambiò lo scopo della vita del Dottor Usui. Mentre il Dottor Usui incominciava uno degli ultimi uffici religiosi domenicali dell'anno scolastico, uno studente anziano prossimo alla laurea, alzò la mano e gli chiese: "Lei accetta alla lettera i contenuti della Bibbia?" 
Il Dottor Usui rispose che credeva in essi. 
Lo studente continuò: "Nella Bibbia si racconta che Gesù curasse i malati, operasse guarigioni e camminasse sulle acque. Lei che accetta integralmente ciò che è riportato nelle scritture, ha mai visto accadere tutto questo?" 
Il Dottor Usui rispose che ci credeva, ma che non aveva mai visto una guarigione, ne qualcuno che camminasse sulle acque.
Lo studente continuò: "Per Lei, Dottor Usui, quel tipo di fiducia cieca è sufficiente, perché Lei ha vissuto la sua vita e possiede le sue sicurezze. Per noi che stiamo appena iniziando le nostre vite da adulti ed abbiamo molte domande e tante inquietudini, non è sufficiente. Noi abbiamo bisogno di vedere con i nostri occhi."
Un seme era stato piantato. 
Il giorno seguente il Dottor Usui si dimise da rettore della Doshisha University ed andò negli Stati Uniti, all'Università di Chicago, dove conseguì il dottorato in Sacre Scritture dedicandosi alla ricerca sul segreto di come Gesù ed i suoi discepoli avevano guarito gli ammalati. Non aveva trovato quello che cercava.
Osservando che nella tradizione Buddista, al Buddha veniva attribuito il potere della guarigione, il Dottor Usui decise di tornare in Giappone per apprendere dal Buddismo quello che poteva essergli utile. 
Al suo ritorno in Giappone, visitò i monasteri Buddisti alla ricerca di qualcuno che fosse interessato alla conoscenza della guarigione fisica. 
Ma ricevette sempre la stessa risposta alle sue domande: "Siamo troppo impegnati nella guarigione dello spirito per preoccuparci della guarigione del corpo."
Finalmente incontrò qualcuno che almeno era interessato al problema della guarigione fisica, un abate anziano di un monastero Zen. Il Dottor Usui chiese di essere ammesso al monastero per poter studiare le scritture sacre dei Buddisti, le sutra, alla ricerca della chiave della guarigione. Vi fu ammesso ed iniziò i suoi studi. Studiò le traduzioni giapponesi delle scritture Buddiste ma non trovò la spiegazione che cercava. Imparò il Cinese per avere un maggior numero di scritture Buddiste da esaminare, ma ancora senza successo.
Allora decise di imparare il Sanscrito, l'antica lingua, per poter leggere le scritture originali del Buddismo e per avere accesso a quelle scritture che non erano mai state tradotte in altre lingue. Finalmente trovò quello che aveva cercato.
 
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